La Guida Pratica dice chiaramente che l'assistente dell'arbitro può "avvertire l'arbitro che per errata individuazione sta ammonendo erroneamente un calciatore, ovvero che sta incorrendo in errore ammonendo per la seconda volta uno stesso calciatore senza espellerlo"
Personalmente darei a quel "può" un significato esteso ("deve"), e ritengo che l'arbitro vada avvertito anche in caso di dubbio. I dubbi si possono sempre chiarire sul momento senza danni, mentre se si lascia proseguire la gara in presenza di errore tecnico vi possono essere conseguenze gravi (cosette tipo annullamento della gara, cazziatone all'arbitro e "ma voi assistenti dormivate?").
Poi sta all'arbitro decidere se chiedere un terzo parere, riconoscere un errore o zittire l'assistente...